Príbeh o chlapcovi z pekla, ktorý sa narodil v roku 1944. Vtedy sa ho snažili využiť prívrženci Zla v nacistických službách – nesmrteľný Rasputin, gestapačka Lisa a maskovaný zabijak Kroenen. Malého diablika ale zachránil a vychoval doktor Broon, ktorý pracoval pre Američanov. Dospelý Hellboy žije v prísne utajenom Ústave na výskum paranormálnych javov a spolu so žabím mužom Sapienom a ženou Liz, ktorá keď sa rozčúli dokáže vyvolať požiar alebo výbuch, sú využívaní pri mimoriadnych operáciách FBI. Zlo sa ale nevzdáva. Trojica pekelných vyslancov sa vracia, aby dokončila svoje temné dielo a Hellboy sa im musí postaviť...